AxyPrep-96 DNA凝膠回收試劑盒
本試劑盒適合從各種瓊脂糖凝膠中回收多至 8 μg 長度在 70 bp-10 kb 的片段,回收率為 60-85%。瓊脂糖凝膠在溫和的緩沖液(DE-A溶液)中熔化,其中的保護劑能防止線狀 DNA在高溫下降解,然后在 DE-B溶液的作用下使 DNA選擇性地結合到膜上。純化的 DNA純度高,并保持片段完整性和高生物活性,可直接用于連接、體外轉錄、PCR 擴增、測序、微注射等分子生物學實驗。
一、試劑盒組成、貯存、穩定性
Cat. No. AP-96-GX-1 AP-96-GX-4 AP-96-GX-24
制備次數 1×96 prep 4×96 preps 24×96 preps
96-well DNA plate- A 1 4 24
96-well 2.2 ml growblock 2 8 48
96-well V-bottom sample plate 1 4 24
Adhesive film 3 15 75
Silicone mat 1 4 24
Buffer DE-A 40 ml 165 ml 2×480 ml
Buffer DE-B 29 ml 80 ml 480 ml
Buffer W2 concentrate 72 ml 2×72 ml 6×150 ml
Eluent 10 ml 25 ml 110 ml
說明書 1 1 1
96-well DNA plate- A:96孔 DNA制備板。
Buffer DE-A:凝膠熔化劑,含 DNA保護劑,防止 DNA在高溫下降解。室溫密閉貯存。
Buffer DE-B:結合液(促使大于 70bp 的 DNA選擇性結合到 DNA制備膜上)。室溫密閉貯存。
Buffer W2 concentrate:去鹽液。*使用前,必須按試劑瓶上的體積加入無水乙醇(可用 100%
乙醇或 95%乙醇),充分混合后使用。每次使用后需將瓶蓋蓋緊,以保持W2中的乙醇含量。
Eluent:洗脫液,室溫密閉貯存。
二、注意事項
1. Buffer DE-A(含有β-巰基乙醇)和 Buffer DE-B含刺激性化合物,操作時要戴乳膠手套和防護眼
鏡,避免沾染皮膚、眼睛和衣服,謹防吸入口鼻。若沾染皮膚、眼睛時,要立即用大量清水或生理
鹽水沖洗,必要時尋求醫療咨詢。
2. 在步驟 1中,將凝膠切成細小的碎塊可大大縮短凝膠熔化時間(線性 DNA長時間暴露在高溫條件
下易于水解),從而提高回收率。勿將含DNA 的凝膠長時間地暴露在紫外燈下,減少紫外線對DNA
造成的損傷。
3. 在步驟 2中凝膠必須*熔化,否則將嚴重影響 DNA回收率。
4. DNA 分子呈酸性,建議在 2.5 mM Tris-HCl,pH7.0-8.5的洗脫液中保存。
三、實驗準備
1. 準備無核酸和核酸酶污染的 Tip 頭。
2. *次使用前,在 Buffer W2 concentrate中加入體積的無水乙醇。
3. 準備 75 °C 水浴。
4. 使用前,檢查 Buffer DE-B是否出現沉淀,若出現沉淀,應于 75 °C 溫浴加熱至沉淀*溶解并冷
卻至室溫后再使用。
四、操作步驟
1. 用干凈鋒利的刀片從瓊脂糖凝膠中切下含有目的 DNA 條帶的凝膠塊,用紙巾吸盡凝膠表面液
體并切碎。計算凝膠重量,該重量作為一個凝膠體積(如 100 mg=100 μl 體積),然后依次放入 96孔 2.2 ml深孔板(試劑盒內提供)孔中。
* 觀察DNA條帶位置時,請盡可能縮短紫外照射時間,以減少紫外誘導突變。電泳時間可適當延長,從而使目的DNA條帶與其他DNA條帶盡可能分開,從而提高回收純度。
2. 加入 3個凝膠體積的 Buffer DE-A,用硅膠片密封各孔(試劑盒內提供),混合均勻后于 75 °C溫浴,間斷混合(每 3-5 min),直至凝膠塊*熔化(15 min左右)。3,000×g 簡短離心使硅膠片上的溶液到 96深孔板中。
* 溫浴及混勻過程中,要確保硅膠片與深孔板貼緊,以免孔間樣品污染。
* Buffer DE-A為紅色溶液。在熔化凝膠的過程中,可以幫助觀察凝膠是否*熔化。
3. 棄硅膠片。每孔加 0.5個 Buffer DE-A體積的 Buffer DE-B,用不干膠片(試劑盒內提供)密封各孔,混合均勻。3,000×g 簡短離心使不干膠片上的溶液到 96深孔板中。當分離的DNA 條帶小于
400 bp 時,應在此溶液中再加入 1個凝膠體積的異丙醇。
* 加Buffer DE-B 后混合物顏色變為黃色,充分混勻以保證形成均一的黃色溶液。
4. 將 96孔 DNA 制備板(試劑盒內提供)置于新的96孔 2.2 ml 深孔板(試劑盒內提供)上,然后將樣品轉移至 96孔 DNA制備板中,用不干膠片密封各孔,3,000×g 離心 5 min,棄濾液。
5. 將 96孔 DNA 制備板置回深孔板上,每孔加800 ml Buffer W2,3,000×g 離心 1 min,棄濾液;以同樣的方法,再用 800 ml Buffer W2洗滌一次,3,000×g 離心 1 min。
* 確認在Buffer W2 concentrate中已按試劑瓶上的體積加入無水乙醇。
* 兩次用Buffer W2沖洗能確保鹽分被*清除,消除對后續反應的影響。
6. 將 96孔DNA制備板置回 96孔 2.2ml 深孔板上,3,000×g 離心 5 min。
7. 將96孔DNA制備板置于潔凈的96孔V型底板(試劑盒內提供)上,在膜正中央加50 ml Eluent或去
離子水,用不干膠片密封各孔,室溫靜置 5 min。3,000×g 室溫離心 5 min洗脫DNA。
* 將Eluent或去離子水加熱至65℃,可提高洗脫效率。